海洋学院成立于2002年7月。建院以来，学院从面向现代化、面向世界、面向未来的战略高度，着眼于21世纪的人才竞争，着眼于中国高等教育的发展方向，乘国家提出的科学强国，技术兴国，大力发展高等教育的东风，主动适应国家经济发展对人才的需要，顺应大学教育国际化的潮流，改革办学体制；紧紧把握学校提出的“建一流学科，办特色大学，向211目标迈进”的发展目标，依托海南丰富的海洋资源，充分利用人才加资源形成的优势，以热带海洋资源的研究、开发、利用和保护为特色，创造条件，创办与经济建设紧密结合的专业，努力发展海洋科学技术，培育海洋技术人才，为建设海南海洋强省服务，为海洋现代化建设输送各类应用型高素质人才。经过短短四年多的建设，学院的办学规模、学科建设、师资队伍建设和实验室建设都得到了快速发展。目前已经成为海南省海洋科学的教学、科研的主要力量，并逐渐形成了自己的特色和优势。
学院现有教职工60名，其中教师50名，具有副高以上专业技术职务者26人，中级专业技术职务者18人，初级专业技术职务者有9人。具有博士学位者18人，硕士学位者18人。有多位教师获得各种荣誉和表彰，有国家级有突出贡献专家1人、享受国务院和省津贴专家5人、全国先进工作者2人，新世纪“百千万人才工程”国家级人选1人、国家跨世纪人才1人、全国优秀教师1人和海南省高等院校青年教师“教学十佳”1人。水产系是全国总工会命名的“全国先进班组”，荣获“五一劳动奖状”。形成了一支思想政治素质高，爱岗敬业，学历较高和职称结构合理的，能够满足教学和科研需要的师资队伍。学院还聘林浩然院士为双聘院士。
学院有海南省首批批准设立的省级重点学科——水产养殖学科，该学科2001年取得硕士学位授予权，2002年开始招收硕士研究生。学科以热带水产养殖动物苗种繁育、热带水产养殖动物病害防治为主要研究方向。到目前为止，该学科集中了一批从事鱼、虾、蟹、贝、藻类研究的专家，成为海南省一支重要的水产科研力量，活跃在海南省的水产、海洋科学研究领域，在水产养殖生产、海洋生物资源研究与开发中起到了重要的作用，2005年学科建设验收成绩优秀。学院拥有海南省热带水生生物重点实验室；还被海南省科技厅批准为海南-东盟科技合作基地。
学院设有水产养殖专业、食品科学与工程专业、制药工程专业、海洋科学专业，水产养殖是海南省重点学科，设有硕士点，以热带水产养殖动植物苗种繁育、热带水产养殖动植物病害防治等为主要研究方向；食品科学与工程专业以海洋食品加工与质量安全为主要研究方向；制药工程专业以生物制药、海洋药物为主要研究方向；海洋科学专业以保护、利用和深度开发海洋生物为主要研究方向。生源来自除上海和西藏外的所有省市，目前有在校本科生711名，研究生52名。
学院在抓好教学工作的同时，充分利用人才加热带海洋生物资源的优势，组织教师积极申报科研课题，取得了明显的成绩。几年来共承担的国家级和省级科研课题达140项，其中包括国家863课题11项，国家转基因专项课题1项，国家自然科学基金课题17项，国际科技合作重点项目4项,国家科技部和教育部的各类科研课题20余项，海南省自然科学基金等省级科研课题30余项，厅级科题近40项，科研总经费达到2300多万元。通过国家或省级鉴定、验收的科技成果35项，获得省部级等科技进步奖33项。主编出版专著7部，发表学术论文共341篇(SCI收录14篇EI收录4篇)。
学院拥有备美观、宽敞的实验教学大楼和较为先进的仪器设，实验室总使用面积为3620.24m2，教学仪器设备总值3401755.5元。学院与企业联合建立了15个校外科研、教学实习基地，基地总面积683540m2。
通过几年的建设，学院图书资料室达到了一定的规模，拥有期刊174种，过刊4934本，现刊488本，共5422册；图书1578种，共2239本，备有阅览桌椅，配备有公用上网电脑，供查询资料。图书资料室已建设为学校图书馆海洋学院分馆。
学院坚持“产学研”紧密结合的办学方针，将充分利用热带海洋研究方面有独特的便利条件，依托自身雄厚的教学和科研力量、知识的前沿性和先进的教学科研手段，并根据科技的发展和社会的需要，设立新的专业。近期以设立应用性学科为主，逐步发展基础学科；中期为在加强应用型学科基础上，逐步发展基础学科；学院的长期目标是以南海热带海洋为依托，构建较为完整的海洋科学研究、教学体系，成为我国热带海洋科学的教学、研究基地。为国家培养具有扎实基础理论和较强动手能力的21世纪创新人材，社会的进步和繁荣作出贡献。
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